Музей є одним із найпотужніших осередків збереження, вивчення й популяризації надбань української духовно-мистецької спадщини, зібрання якого налічують понад 170 тис. одиниць. Предмет особливої гордості — найбагатша в Україні збірка середньовічного сакрального мистецтва ХІІ–ХVІІІ століть, що містить понад 10 000 творів. Цінними є зібрання давніх пам’яток писемної та книговидавничої культури, графіки, українського образотворчого й народного декоративно-прикладного мистецтва ХІХ–ХХ століть.